En raison du durcissement progressif des normes sur la teneur en soufre des carburants automobiles, la désulfuration biologique est souvent envisagée comme une alternative possible aux procédés d'hydrodésulfuration (HDS) profonde utilisés dans l'industrie du raffinage. La première souche microbienne capable d'oxyder spécifiquement le soufre d'une molécule comme le dibenzothiophène (DBT) sans affecter son contenu carboné, Rhodococcus erythropolis IGTS8, a été isolée il y a plus de dix ans. La voie métabolique suivie (voie des 4S) a été élucidée et les gènes responsables caractérisés et séquencés. La présente étude vise à tirer profit de la biodiversité microbienne pour sélectionner, sur la base de critères importants du point de vue industriel, de nouvelles souches potentiellement intéressantes pour une désulfuration ultraprofonde des gazoles. Dans un premier temps, 15 souches pures capables d'utiliser le DBT comme seule source de soufre et de le convertir en 2-hydroxybiphényle (HBP) ont été isolées à partir de différents sols. Dans un second temps, 5 isolats appartenant au cluster Rhodococcus/Gordonia, ayant une bonne croissance et de fortes activités de désulfuration aussi bien en milieu aqueux qu'en milieu organique ont été sélectionnés. L'action des cellules non proliférantes obtenues à partir de ces souches vis-à-vis de différents types de gazole a été déterminée afin de mieux évaluer les potentialités de la biodésulfuration comme étape de finition d'une hydrodésulfuration profonde. En fait, malgré leur forte similitude taxonomique, les 5 souches ont des activités différentes sur les gazoles testés. Le taux de désulfuration dépend également du type de gazole, en particulier de sa teneur en soufre. Certains composés récalcitrants à l'HDS, comme le 4,6-diméthyl dibenzothiophène, peuvent être totalement désulfurés, mais les dibenzothiophènes fortement alkylés sont résistants à l'action des biocatalyseurs.